1966～1976年 “文化大革命”时期

1966年“文化大革命”开始后，医院遭到摧残、破坏，首先是王清贵院长住进汾阳县举办的“宗教学习班”，后被医院造反派抓回批斗。接着王祝康、张哲等院领导被隔离、围攻。院一级领导和中层干部大多数被点名批判；知识分子受到压制、歧视；医务人员不敢钻研业务；管理不善，医院物资和器械丢失损坏严重；护理人员不安心工作，实行医护一条龙，三级护理被取消；医务人员得不到补充，技术队伍青黄不接，医务质量下降。1968年4月，由于汾阳县两派武斗升级，导致医院关门停诊。

1969年3月29日，医院成立革命委员会，张宪源任主任。当时，张宪源在困难的条件下，带领全院职工狠抓医疗工作。在这一阶段，根据上级精神，也搞了“清理阶级队伍”“一打三反”等运动，一些受到错误处理，有的下放基层。同时落实“深挖洞”精神，在院内城墙根底挖了地下防空洞。

1972年后中共中央提出落实知识分子政策。1975年，又对各条战线进行整顿，党的知识分子政策也得到了一定程度的落实，因而这3年医院工作在曲折中有发展。

1969年，医院成功抢救本县孝臣大队52名食物中毒的农民；切除41公斤的巨大股骨巨细胞瘤。1970年，派出医疗队下乡，对当时的农村合作医疗工作给予支持。1971年4月14日，吕梁地区恢复组建，从此医院作为吕梁东部的医疗服务中心，工作量增大，医院在整体工作上取得较大进展。1971年12月18日，张宪源出席吕梁地区首届党代会。1971年至1972年，医院开展中西医结合治疗宫外孕、外科急腹症，并开展了针刺麻醉。1974年，申请得到省卫生厅投资16万元，进行医院旧楼维修，经过近一年时间，有50多年历史的住院楼整修如新。同年成功抢救3·20汽车失火事件一批大面积烧伤患者。这段时期，在办院方针上，坚持面向农村，以县、社、队三级医疗网为基础，有疫情逐级上报，疑难病人逐级诊治，医务人员逐级培训，科研工作逐级指导。通过以上“四逐级”，实行医疗、预防、教学、科研四结合，受到主管部门的肯定和表彰，中央卫生部为此发了简报。《山西日报》、山西广播电台等多次报道医院事迹。《山西日报》评价当时的汾阳医院是：“敞开医院大门，热情接待农民群众；走出医院大门，为农村送医送药上门；请进医院大门，为农村培训赤脚医生。”1975年3月25日，医院党支部、团支部、民兵连共同出席吕梁地区群英会。6月26日，《人民日报》刊登汾阳医院为农村培养医务人员的消息。8年中，培养农村医生700多人。1974年至1976年，医院建起面积1610平方米的3层门诊楼1座。1976年，全院床位175张，职工166人。